3-4 октября 2012 г. в Санкт –Петербургской православной духовной академии состоялась IV Международная научно-богословская конференция «Актуальные вопросы богословских исследований», в которой приняли участие  зав.кафедрой библейской теологии  семинарии, кандидат богословия иерей Юлиан Гоголюк  и воспитанник семинарии 4 курса Швец Никита. 

31 августа  2012  года в  Белгородской Православной Духовной семинарии ( с миссионерской направленностью) накануне нового учебного года состоялось  заседание Ученого совета, которое возглавил Высокопреосвященный Иоанн, Митрополит Белгородский и Старооскольский. В заседании приняло  участие  44 преподавателя семинарии.
 

К началу нового  2012-2013 учебного года в  Белгородской Православной Духовной семинарии ( с миссионерской направленностью) по благословению Высокопреосвященного Иоанна, митрополита Белгородского и Старооскольского,  вышел в свет учебник «Общая психология», написанный  преподавателем психологии  Труновой Анной  Григорьевной. В основу учебника был положен курс лекций по предмету "Общая психология",  который автор преподает в семинарии  на протяжении пяти лет.

26 июля 2012 г. по благословению Высокопреосвященного Митрополита Белгородского и Старооскольского Иоанна в семинарском храме во имя свт.Иннокентия Московского и Коломенского свое первое богослужение  в новом сане провел епископ Губкинский и Грайворонский Софроний - выпускник Белгородской Православной Духовной семинарии ( с миссионерской направленностью) 2000 г., хиротонисанный во епископа 22 июля 2012 г. Святейшим Патриархом Московским и всея Руси  Кириллом.   Знаменательное богослужение молодого епископа в родных пенатах  собрало  вместе многих его однокурсников, ныне священнослужителей, приехавших   из Липецкой, Сумской, Якутской и Белгородской епархий, а также прихожан  семинарского храма и сотрудников семинарии.

В Белгородском социальном реабилитационном центре, расположенном на Крейде по улице Макаренко 18, с 01 июля  по  08 июля 2012 года прошла неделя, посвященная празднованию Дня любви, семьи и верности. Для проведения бесед с учащимися были приглашены воспитанники Белгородской Православной Духовной семинарии 4 курса Яковов Даниил и Швец Никита.

8 июня в рамках реализации проекта-победителя БПДС (с м/н) по изданию УМК "Православная культура: история и традиции" и введению его в педагогическую практику в учебных заведениях Белгородской области при сотрудничестве Белгородской Православной Духовной семинарии и социально-теологического факультета БелГУ и поддержке Департамента образования, культуры и молодежной политики Белгородской области в библиотеке социально-теологического факультета Белгородского Государственного Университета состоялся семинар-совещание независимых экспертов — преподавателей вузов Белгородской области по вопросу использования УМК "Православная культура: история и традиции" в светских вузах.