31 августа 2013г. под руководством  Высокопреосвященного ректора, Митрополита Белгородского и Старооскольского Иоанна, состоялось  первое в новом  2013-2014  учебном году заседание  Ученого совета  семинарии, в котором  приняло  участие 50  преподавателей  семинарии, включая ректорат и  администрацию.

25 августа 2013 года в Белгороде, на сцене парка Победы, в 21.00 прошло мероприятие, посвященное памяти пострадавших от деятельности деструктивных тоталитарных религиозных организаций. Вечер начался с показа на экране видеоролика «Духовная безопасность».

С 14 по 21 и с 21 по 28 июля на озере Селигер (пос. Светлица, Тверская область) проходили смены Всероссийского Молодежного Форума «Селигер-2013». Воспитанник Белгородской Православной Духовной семинарии (с миссионерской направленностью) чтец Иван Моисеев принял активное участие в работе форума.

«Рецепция  русской мысли в Европе» - так называлась международная научная  конференция, прошедшая  в Кракове (Польша) 27-28 июня 2013 года. Организаторами конференции

4 июня 2013 года в Белгородской Православной Духовной семинарии состоялось административное  совещание, которое  возглавил Высокопреосвященный ректор, митрополит  Белгородский и Старооскольский Иоанн. В совещании приняли участие проректор по учебной работе протоиерей Алексий Куренков, проректор по научной работе  игумен Серапион (Митько),

     1 июня 2013 года, в день святых новомучеников Белгородских,  ректор Белгородской Православной Духовной семинарии Высокопреосвященный Иоанн, Митрополит Белгородский и Старооскольский  в семинарском храме во имя святителя Иннокентия, митрополита Московского и Коломенского  совершил хиротесию - чин поставления во чтецов - 13  воспитанников  4  курса очного отделения.