18 мая 2013 г. по благословению Высокопреосвященного Иоанна, Митрополита Белгородского и Старооскольского, в Белгородской Православной Духовной семинарии  ( с миссионерской направленностью) состоялась 1-я студенческая  конференция на тему "Второе Крещение - особенности миссионерской деятельности в современных условиях", организованная  Белгородской  семинарией совместно с Синодальным Миссионерским Отделом и Социально-Теологическим факультетом БелГУ. Возглавил   конференцию  проректор по научной работе доктор богословия кандидат философских наук игумен Серапион (Митько). В работе конференции также приняли участие:

15  мая 2013 года   на базе  теологического факультета НИУ БелГУ  состоялась научно-практическая конференция “Евангелие в контексте  современной культуры». Конференция была подготовлена и проведена  по благословению  Высокопреосвященного Иоанна, Митрополита Белгородского  и Старооскольского . Ее организаторами стали Белгородская митрополия, социально-теологический  факультет  НИУ БелГУ, Образовательно-методический центр «Преображение» (г.Белгород) и Белгородская Православная Духовная семинария ( с миссионерской направленностью).

    8 мая 2013 года  по Благословению Высокопреосвященнейшего  Иоанна, Митрополита Белгородского и Старооскольского, православное молодежное общество «Экклесия», созданное по инициативе воспитанников Белгородской  Православной Духовной семинарии,  совместно с Духовно-просветительским центром во имя святых мучениц Веры, Надежды, Любови и матери их Софии, а также общественным движением «Скорая Молодежная Помощь»  с 19.00 до 21.00 провели в г. Белгороде молодежную просветительскую акцию "Пасхальная Радость".

23 апреля 2013 года  в Белгородской Православной Духовной семинарии ( с миссионерской направленностью) состоялось очередное -  четвертое в 2012-2013 учебном году - заседание Ученого совета под руководством Высокопреосвященного ректора, Митрополита Белгородского и Старооскольского Иоанна, при участии 45 преподавателей Семинарии. Предварила заседание панихида

29 марта 2103 г. завершилось обучение на курсах миссионеров в межъепархиальном обучающем Центре при Белгородской Православной Духовной семинарии.

     В Белгородской семинарии  27 марта  2013 года Высокопреосвященный ректор  Митрополит  Белгородский и Старооскольский Иоанн возглавил Литургию Преждеосвященных Даров в семинарском  храме во имя свт.Иннокентия, Митрополита Московского и Коломенского.